包皮过长的害处归结起来主要有以下几点：
一、影响阴茎发育：包茎和包皮过长会影响阴茎的生长发育，使性器官发育成熟后的阴茎头冠部的周径明显小，此外还能影响正常的性生活，性快感降低。
二、容易使阴茎发炎：包皮内有丰富的皮脂腺分泌大量的皮脂。包茎或包皮过长时，皮脂和尿中的沉淀物不能排出形成乳酪状奇臭的“包皮垢”甚至形成“包皮结石”。包皮垢适宜细菌生长，故可引起龟头及包皮发炎。
三、容易上行感染甚至损害内脏：由于阴茎发炎，可以导致尿道发炎，尿道发炎以后可能症状会比较轻微，不会引起人的注意，通过喝水、排尿，症状消失了，病人不会察觉到有问题。殊不知，致病菌还会慢慢逆行往上感染，引发前列腺炎、精囊炎、附睾炎、甚至膀胱炎、肾炎等。
四、有致癌的危险：现代科学研究表明，长时间包皮垢的刺激可以大大增加患阴茎癌的风险。
